Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC154A6NI56 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC154A6NI56 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC154A6NI56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms