Protein–RNA interactions for Protein: A6NGU7

LINC01546, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01546, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01546A6NGU7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC01546A6NGU7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC01546A6NGU7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC01546A6NGU7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms