Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PGPEP1LA6NFU8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PGPEP1LA6NFU8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PGPEP1LA6NFU8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms