Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CFAP73A6NFT4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CFAP73A6NFT4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CFAP73A6NFT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms