Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LINC00862A6NCI5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00862A6NCI5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00862A6NCI5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms