Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRBA1A5PL33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRBA1A5PL33 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KRBA1A5PL33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms