Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIPSLA2A3N6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPSLA2A3N6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPSLA2A3N6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms