Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQC6

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQC6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
A0A1W2PQC6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1W2PQC6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1W2PQC6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms