Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0J9YVX5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A0J9YVX5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A0J9YVX5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms