Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNX13Q9Y5W8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms