Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
IGSF9BQ9UPX0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
IGSF9BQ9UPX0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms