Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNRF3Q9ULT6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms