Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB23Q9ULC3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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RAB23Q9ULC3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB23Q9ULC3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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