Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEW3

MARCO, Macrophage receptor MARCO, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCOQ9UEW3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MARCOQ9UEW3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms