Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLIP2Q9UDT6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms