Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SH3BP4Q9P0V3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SH3BP4Q9P0V3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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