Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms