Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOBEC3GQ9HC16 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
APOBEC3GQ9HC16 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.8 ms