Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SEMA4CQ9C0C4 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms