Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM55Q9BYV6 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms