Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDM5DQ9BY66 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms