Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HDAC8Q9BY41 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms