Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HIRIP3Q9BW71 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms