Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1orf50Q9BV19 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms