Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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C9orf16Q9BUW7 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
C9orf16Q9BUW7 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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