Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PAGR1Q9BTK6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms