Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HDAC10Q969S8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HDAC10Q969S8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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HDAC10Q969S8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC10Q969S8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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