Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GTF3C6Q969F1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C6Q969F1 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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