Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SCAMP4Q969E2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SCAMP4Q969E2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms