Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVX3

C4orf3, Uncharacterized protein C4orf3, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf3Q8WVX3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
C4orf3Q8WVX3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms