Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM71DQ8N9W8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms