Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RYBPQ8N488 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms