Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RPAP2Q8IXW5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RPAP2Q8IXW5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms