Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms