Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC84Q86UT8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC84Q86UT8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms