Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC149Q6ZUS6 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms