Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMC5Q6UXY8 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMC5Q6UXY8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms