Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VSTM1Q6UX27 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms