Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TTC19Q6DKK2 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTC19Q6DKK2 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms