Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DUPD1Q68J44 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms