Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG16L1Q676U5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG16L1Q676U5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms