Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
UBAP2Q5T6F2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms