Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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SGO1Q5FBB7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SGO1Q5FBB7 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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