Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TDRD12Q587J7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms