Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SLC45A2-202ENST00000382102 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AL122035.2-201ENST00000609125 1870 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 RASGRP4-207ENST00000587738 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UGT1A10-201ENST00000344644 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FCRLA-206ENST00000367949 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC009060.1-202ENST00000502126 2242 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
ANKRD39Q53RE8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms