Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDLIM3Q53GG5 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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