Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KLHL40Q2TBA0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms