Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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RRN3P1Q2M238 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RRN3P1Q2M238 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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