Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL24A1Q17RW2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
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COL24A1Q17RW2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
COL24A1Q17RW2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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