Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPROQ16827 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPROQ16827 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPROQ16827 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPROQ16827 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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PTPROQ16827 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PTPROQ16827 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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